Drug 5

Drug, drug targets

Drug좋은 약이랑 나쁜 약은 무엇일까?페니실린과 같은 약은 좋은 drug, 헤로인은 나쁜 drug 이런식으로 분류가 가능할까대마초나 니코틴, 알코올은 어디에 포함되어야 할까이런 질문에 대한 답은 어떤 관점이냐에 따라 달려있는 것 같다. 법의 규정에 따르면 명확히 구분할 수 있지만 약을 공부하는 관점에서는 좋은 약, 나쁜 약으로 분류하기에는 약의 효과는 너무 다양한 것 같다. 그래도 흔히 말하는 좋은 약에 대해 잠깐 생각해보면 의도한 효과를 나타내고, 독성이나 부작용이 없으며 복용이 간편하다면 좋은 약이라고 할 수 있을 것 같다. 페니실린은 지금까지 발견된 가장 안전하고 효과적인 항균제 중 하나이지만 모든 세균을 죽일 수 없고 시간이 지나면 세균 균주가 내성을 가질 수 있다는 단점이 있다. 모르핀은 효..

T003 · Molecular filtering: unwanted substructures

0. Talktorials모든 study 는 TeachOpenCADD 를 바탕으로 구성하였습니다.  T003 · Molecular filtering: unwanted substructures — TeachOpenCADD 0 documentation  Github:volkamerlab/teachopencadd: TeachOpenCADD: a teaching platform for computer-aided drug design (CADD) using open source packages and data  1. Theory 1-1. Unwanted substructures Substructures 는 unfavorable 할 수 있습니다.  [이유]toxic (독성)reactive (반응성이 높음)unfav..

T002 · Molecular filtering: ADME and lead-likeness criteria

0. Talktorials모든 study 는 TeachOpenCADD 를 바탕으로 구성하였습니다.  T002 · Molecular filtering: ADME and lead-likeness criteria — TeachOpenCADD 0 documentation   Github:volkamerlab/teachopencadd: TeachOpenCADD: a teaching platform for computer-aided drug design (CADD) using open source packages and data   1. TheoryVirtual screening 에서는 compound 가 특정 target 과 결합하고 interaction 할 수 있는지 예측하는 것을 목표로 합니다. 이 뿐만 아니..

T001 · Compound data acquisition (ChEMBL)

0. Talktorials모든 study 는 TeachOpenCADD 를 바탕으로 구성하였습니다. T001 · Compound data acquisition (ChEMBL) — TeachOpenCADD 0 documentation Github:volkamerlab/teachopencadd: TeachOpenCADD: a teaching platform for computer-aided drug design (CADD) using open source packages and data 1. Theory 1-1. ChEMBL database “ChEMBL is a manually curated database of bioactive molecules with drug-like properties. It bri..

Binding Sites 와 kinase selectivity

Binding Sites란? Binding sites는 ligand(substrates, inhibitors, other molecules)들이 다양한 분자 상호작용을 통해 부착될 수 있는 특정 분자의 위치를 말합니다. Binding sites는 많은 생물학적 분자의 기능에 매우 중요하며, 일반적으로 protein의 표면 또는 3차원 구조 내부에 위치해 있습니다. Ligand가 binding sites에 결합할 때 Protein의 구조 변화가 일어나며 이 변화는 protein의 기능을 활성화하거나 억제할 수 있습니다. Binding 과정은 효소 촉매 작용, 신호 전달, 분자 인식 등 수많은 생물학적 과정에서 필수적입니다. 예를 들어, 효소에서 기질이 결합하는 부위는 주로 active site라고 부르며,..

Drug study/Deepchem 2024.10.09