[펩타이드] 3D 구조에서 L-form D-form 구별하기

[PDB] 6BVY

 

펩타이드를 3D 구조로 살펴볼 때 여러 펩타이드가 bond를 이루고 있어서

특정 펩타이드가 L-form인지 D-form인지 헷갈릴 때가 있다. 빠르게 파악하는 방법을 알아보자!

 

[1] 아미노산의 기본 구조를 항상 생각하기

COOH, R기, NH2, H 그리고 Cα

 

[2] Cα를 바라보면서 H를 뒤로 둔다.

 

[3] Cα를 기준으로 COOH와 NH2, R기가 어디있는지 확인하기

- 위의 그림처럼 시계방향으로 CO - N - R 순서로 있으면 L-form이다. 

 

 

연습

 

위의 그림에서 Cα를 기준으로 H를 뒤로 둔 상태이다.

 

먼저 왼쪽에 CO, 오른쪽 R기, 그 밑에 N 

시계방향으로 CO-R-N이다. 따라서 D-form이다.