[Adobe illustrator] chemical compound 시각화

 

 

출처
rdkit.Chem.Draw package — The RDKit 2025.03.3 documentation

 

 

시각화 하는 방법 전에 한 가지, 라이센스가 있는 tool이 있으면 그것을 쓰자.. (paper 사용 가능 여부는 확인하기)

 

from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw

mol = Chem.MolFromSmiles('c1ccccc1O')
Draw.MolToFile(mol, 'sup1.svg')

 

Adobe illustrator는 svg 파일 인식이 가능합니다. 

 

파일을 열면 이런식으로 compound 구조가 보입니다.

Adobe illustrator에는 드래그 해서 추가하면 됩니다. 

 

 

 

추가하면 이런식으로 파일이 들어오는데 드래그 후 복사해서 figure 작업창에 붙여넣기 하면 됩니다.

 

 

처음엔 이런식으로 들어오는데 흰 배경 제거해주고 shift 누른상태에서 compound 크기 조절해주면 됩니다.

 

 

 

compound가 굉장히 압축되어 있는데

 

 

 

선 하나하나를 다 인식하기 때문에 두께를 0.5pt로 줄여주면 됩니다. (처음엔 두께 인식이 안 될 수도 있어서 화살표 클릭하지말고 숫자 직접 입력 해보기)